Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHAF1BQ13112 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHAF1BQ13112 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHAF1BQ13112 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHAF1BQ13112 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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