Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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