Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms