Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFEMP1Q12805 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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