Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFFO1Q0D2I5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms