Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF415Q09FC8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms