Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms