Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms