Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms