Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms