Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms