Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms