Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HBBP68871 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms