Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GJA9P57773 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms