Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms