Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC13P55735 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC13P55735 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC13P55735 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms