Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP3P54852 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP3P54852 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP3P54852 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP3P54852 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP3P54852 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP3P54852 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP3P54852 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms