Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNQ1P51787 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms