Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms