Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNJ1P48048 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms