Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQGAP1P46940 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms