Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA1P42261 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms