Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMPOP42166 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMPOP42166 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPOP42166 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPOP42166 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMPOP42166 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMPOP42166 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPOP42166 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms