Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MLH1P40692 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms