Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA3P35244 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms