Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKBRP32239 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms