Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms