Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms