Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms