Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD27P26842 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD27P26842 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD27P26842 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms