Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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