Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XPAP23025 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XPAP23025 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XPAP23025 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms