Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms