Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LBPP18428 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LBPP18428 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LBPP18428 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LBPP18428 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms