Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAV1P15498 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAV1P15498 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms