Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms