Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODC1P11926 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODC1P11926 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODC1P11926 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms