Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMDP11532 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DMDP11532 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms