Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI2P10070 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI2P10070 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI2P10070 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms