Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGPD2P0DJD1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms