Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTPBP07988 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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SFTPBP07988 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SFTPBP07988 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SFTPBP07988 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPBP07988 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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