Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms