Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGB3P05106 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms