Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms