Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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