Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms