Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms