Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TIMM17BO60830 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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TIMM17BO60830 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TIMM17BO60830 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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