Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD6O43541 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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