Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCAO15360 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms